Protein–RNA interactions for Protein: P07205

PGK2, Phosphoglycerate kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGK2P07205 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGK2P07205 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGK2P07205 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGK2P07205 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGK2P07205 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGK2P07205 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGK2P07205 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGK2P07205 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGK2P07205 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGK2P07205 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGK2P07205 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PGK2P07205 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGK2P07205 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGK2P07205 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGK2P07205 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGK2P07205 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGK2P07205 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGK2P07205 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGK2P07205 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGK2P07205 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGK2P07205 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PGK2P07205 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGK2P07205 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PGK2P07205 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PGK2P07205 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGK2P07205 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGK2P07205 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGK2P07205 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGK2P07205 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGK2P07205 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGK2P07205 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PGK2P07205 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGK2P07205 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGK2P07205 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGK2P07205 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGK2P07205 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PGK2P07205 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGK2P07205 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGK2P07205 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGK2P07205 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGK2P07205 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGK2P07205 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGK2P07205 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGK2P07205 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGK2P07205 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGK2P07205 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PGK2P07205 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PGK2P07205 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGK2P07205 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGK2P07205 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGK2P07205 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGK2P07205 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGK2P07205 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGK2P07205 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGK2P07205 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGK2P07205 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGK2P07205 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGK2P07205 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGK2P07205 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGK2P07205 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGK2P07205 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGK2P07205 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGK2P07205 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGK2P07205 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGK2P07205 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGK2P07205 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGK2P07205 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGK2P07205 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGK2P07205 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGK2P07205 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGK2P07205 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGK2P07205 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGK2P07205 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGK2P07205 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGK2P07205 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGK2P07205 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGK2P07205 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGK2P07205 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGK2P07205 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGK2P07205 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGK2P07205 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGK2P07205 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGK2P07205 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGK2P07205 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGK2P07205 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGK2P07205 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGK2P07205 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGK2P07205 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGK2P07205 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PGK2P07205 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGK2P07205 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGK2P07205 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGK2P07205 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGK2P07205 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGK2P07205 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGK2P07205 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGK2P07205 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGK2P07205 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PGK2P07205 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGK2P07205 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms