Protein–RNA interactions for Protein: P05976

MYL1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL1P05976 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MYL1P05976 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYL1P05976 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYL1P05976 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYL1P05976 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYL1P05976 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYL1P05976 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MYL1P05976 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYL1P05976 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYL1P05976 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYL1P05976 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYL1P05976 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYL1P05976 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYL1P05976 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MYL1P05976 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYL1P05976 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYL1P05976 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYL1P05976 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYL1P05976 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYL1P05976 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYL1P05976 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYL1P05976 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYL1P05976 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYL1P05976 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYL1P05976 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYL1P05976 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYL1P05976 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYL1P05976 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYL1P05976 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYL1P05976 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYL1P05976 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYL1P05976 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYL1P05976 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYL1P05976 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYL1P05976 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYL1P05976 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYL1P05976 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYL1P05976 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYL1P05976 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYL1P05976 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYL1P05976 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MYL1P05976 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYL1P05976 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYL1P05976 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYL1P05976 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYL1P05976 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYL1P05976 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYL1P05976 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYL1P05976 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYL1P05976 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYL1P05976 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYL1P05976 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYL1P05976 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MYL1P05976 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYL1P05976 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYL1P05976 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYL1P05976 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYL1P05976 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYL1P05976 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYL1P05976 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYL1P05976 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYL1P05976 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYL1P05976 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYL1P05976 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYL1P05976 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYL1P05976 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYL1P05976 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MYL1P05976 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYL1P05976 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYL1P05976 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYL1P05976 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYL1P05976 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYL1P05976 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYL1P05976 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYL1P05976 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYL1P05976 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYL1P05976 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYL1P05976 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYL1P05976 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MYL1P05976 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MYL1P05976 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYL1P05976 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYL1P05976 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MYL1P05976 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYL1P05976 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYL1P05976 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MYL1P05976 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYL1P05976 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYL1P05976 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MYL1P05976 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MYL1P05976 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MYL1P05976 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MYL1P05976 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYL1P05976 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYL1P05976 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYL1P05976 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYL1P05976 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYL1P05976 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYL1P05976 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYL1P05976 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms