Protein–RNA interactions for Protein: P02778

CXCL10, C-X-C motif chemokine 10, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL10P02778 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CXCL10P02778 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCL10P02778 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CXCL10P02778 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CXCL10P02778 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXCL10P02778 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXCL10P02778 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXCL10P02778 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CXCL10P02778 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXCL10P02778 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXCL10P02778 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXCL10P02778 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXCL10P02778 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXCL10P02778 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CXCL10P02778 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXCL10P02778 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCL10P02778 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCL10P02778 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCL10P02778 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCL10P02778 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCL10P02778 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCL10P02778 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCL10P02778 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCL10P02778 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCL10P02778 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCL10P02778 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCL10P02778 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCL10P02778 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCL10P02778 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms