Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC3P02656 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC3P02656 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC3P02656 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC3P02656 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC3P02656 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC3P02656 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC3P02656 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC3P02656 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC3P02656 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC3P02656 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC3P02656 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC3P02656 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC3P02656 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC3P02656 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC3P02656 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC3P02656 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC3P02656 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC3P02656 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC3P02656 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC3P02656 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC3P02656 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC3P02656 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC3P02656 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC3P02656 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC3P02656 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC3P02656 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC3P02656 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC3P02656 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC3P02656 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC3P02656 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC3P02656 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC3P02656 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOC3P02656 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOC3P02656 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOC3P02656 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOC3P02656 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOC3P02656 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOC3P02656 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOC3P02656 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC3P02656 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC3P02656 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC3P02656 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC3P02656 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC3P02656 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC3P02656 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC3P02656 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC3P02656 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC3P02656 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC3P02656 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC3P02656 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC3P02656 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC3P02656 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC3P02656 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC3P02656 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC3P02656 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOC3P02656 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOC3P02656 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOC3P02656 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOC3P02656 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
APOC3P02656 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
APOC3P02656 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOC3P02656 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOC3P02656 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOC3P02656 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOC3P02656 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOC3P02656 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOC3P02656 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOC3P02656 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOC3P02656 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOC3P02656 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOC3P02656 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC3P02656 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC3P02656 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC3P02656 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC3P02656 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC3P02656 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC3P02656 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC3P02656 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC3P02656 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC3P02656 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC3P02656 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC3P02656 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC3P02656 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC3P02656 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC3P02656 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC3P02656 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC3P02656 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC3P02656 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC3P02656 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC3P02656 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC3P02656 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC3P02656 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC3P02656 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC3P02656 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC3P02656 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC3P02656 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC3P02656 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC3P02656 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC3P02656 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms