Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOEP02649 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOEP02649 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOEP02649 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
APOEP02649 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOEP02649 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOEP02649 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOEP02649 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOEP02649 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOEP02649 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOEP02649 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOEP02649 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOEP02649 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOEP02649 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOEP02649 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOEP02649 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOEP02649 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOEP02649 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOEP02649 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOEP02649 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOEP02649 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
APOEP02649 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOEP02649 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOEP02649 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOEP02649 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOEP02649 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOEP02649 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOEP02649 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOEP02649 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOEP02649 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOEP02649 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOEP02649 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOEP02649 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOEP02649 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOEP02649 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
APOEP02649 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOEP02649 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOEP02649 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
APOEP02649 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOEP02649 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOEP02649 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOEP02649 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOEP02649 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOEP02649 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOEP02649 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOEP02649 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOEP02649 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOEP02649 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOEP02649 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOEP02649 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOEP02649 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOEP02649 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOEP02649 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOEP02649 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOEP02649 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOEP02649 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOEP02649 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
APOEP02649 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOEP02649 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
APOEP02649 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOEP02649 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOEP02649 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOEP02649 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
APOEP02649 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOEP02649 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOEP02649 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
APOEP02649 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOEP02649 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOEP02649 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOEP02649 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOEP02649 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOEP02649 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOEP02649 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOEP02649 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOEP02649 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOEP02649 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOEP02649 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOEP02649 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOEP02649 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOEP02649 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOEP02649 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
APOEP02649 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOEP02649 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOEP02649 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOEP02649 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOEP02649 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOEP02649 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOEP02649 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOEP02649 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOEP02649 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOEP02649 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOEP02649 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOEP02649 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOEP02649 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOEP02649 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOEP02649 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOEP02649 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOEP02649 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOEP02649 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
APOEP02649 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms