Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNAP02545 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNAP02545 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNAP02545 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNAP02545 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNAP02545 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNAP02545 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNAP02545 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNAP02545 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNAP02545 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNAP02545 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNAP02545 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNAP02545 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNAP02545 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNAP02545 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNAP02545 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNAP02545 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNAP02545 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNAP02545 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNAP02545 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNAP02545 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNAP02545 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNAP02545 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNAP02545 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNAP02545 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNAP02545 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNAP02545 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNAP02545 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNAP02545 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNAP02545 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNAP02545 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNAP02545 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNAP02545 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNAP02545 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNAP02545 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNAP02545 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNAP02545 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNAP02545 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNAP02545 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNAP02545 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNAP02545 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNAP02545 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNAP02545 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNAP02545 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMNAP02545 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNAP02545 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNAP02545 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNAP02545 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNAP02545 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNAP02545 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNAP02545 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNAP02545 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNAP02545 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNAP02545 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNAP02545 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNAP02545 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMNAP02545 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LMNAP02545 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNAP02545 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNAP02545 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNAP02545 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNAP02545 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMNAP02545 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNAP02545 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNAP02545 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNAP02545 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNAP02545 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNAP02545 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNAP02545 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNAP02545 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNAP02545 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNAP02545 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNAP02545 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNAP02545 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMNAP02545 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNAP02545 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNAP02545 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNAP02545 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNAP02545 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNAP02545 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNAP02545 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNAP02545 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNAP02545 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNAP02545 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNAP02545 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNAP02545 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNAP02545 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMNAP02545 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNAP02545 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNAP02545 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNAP02545 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNAP02545 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNAP02545 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNAP02545 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNAP02545 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNAP02545 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNAP02545 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNAP02545 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNAP02545 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNAP02545 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms