Protein–RNA interactions for Protein: P01730

CD4, T-cell surface glycoprotein CD4, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD4P01730 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD4P01730 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD4P01730 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD4P01730 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD4P01730 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CD4P01730 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD4P01730 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD4P01730 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD4P01730 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD4P01730 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD4P01730 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD4P01730 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD4P01730 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD4P01730 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD4P01730 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CD4P01730 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD4P01730 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD4P01730 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD4P01730 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD4P01730 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD4P01730 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD4P01730 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD4P01730 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD4P01730 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD4P01730 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD4P01730 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD4P01730 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD4P01730 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CD4P01730 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD4P01730 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD4P01730 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD4P01730 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD4P01730 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD4P01730 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD4P01730 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD4P01730 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CD4P01730 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD4P01730 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD4P01730 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD4P01730 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD4P01730 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD4P01730 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD4P01730 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD4P01730 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD4P01730 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD4P01730 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD4P01730 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD4P01730 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD4P01730 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD4P01730 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD4P01730 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD4P01730 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD4P01730 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD4P01730 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD4P01730 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD4P01730 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD4P01730 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD4P01730 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD4P01730 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD4P01730 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CD4P01730 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD4P01730 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD4P01730 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD4P01730 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD4P01730 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD4P01730 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD4P01730 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD4P01730 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD4P01730 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD4P01730 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD4P01730 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD4P01730 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CD4P01730 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD4P01730 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD4P01730 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD4P01730 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD4P01730 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD4P01730 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD4P01730 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD4P01730 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD4P01730 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD4P01730 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD4P01730 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD4P01730 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD4P01730 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD4P01730 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD4P01730 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD4P01730 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD4P01730 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD4P01730 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD4P01730 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD4P01730 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD4P01730 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD4P01730 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD4P01730 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD4P01730 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD4P01730 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD4P01730 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD4P01730 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD4P01730 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms