Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFNB1P01574 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
IFNB1P01574 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNB1P01574 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms