Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX6O95503 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX6O95503 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CBX6O95503 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CBX6O95503 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CBX6O95503 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CBX6O95503 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX6O95503 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX6O95503 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX6O95503 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX6O95503 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX6O95503 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX6O95503 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX6O95503 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX6O95503 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX6O95503 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX6O95503 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX6O95503 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX6O95503 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX6O95503 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX6O95503 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX6O95503 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX6O95503 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX6O95503 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX6O95503 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX6O95503 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX6O95503 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX6O95503 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX6O95503 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX6O95503 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX6O95503 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX6O95503 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX6O95503 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX6O95503 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX6O95503 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX6O95503 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX6O95503 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX6O95503 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX6O95503 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX6O95503 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX6O95503 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX6O95503 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX6O95503 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX6O95503 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX6O95503 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX6O95503 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX6O95503 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX6O95503 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX6O95503 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX6O95503 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX6O95503 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX6O95503 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX6O95503 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX6O95503 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX6O95503 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX6O95503 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX6O95503 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX6O95503 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX6O95503 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX6O95503 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX6O95503 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX6O95503 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX6O95503 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX6O95503 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX6O95503 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX6O95503 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX6O95503 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX6O95503 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX6O95503 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX6O95503 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX6O95503 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX6O95503 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX6O95503 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CBX6O95503 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CBX6O95503 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX6O95503 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX6O95503 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX6O95503 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX6O95503 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX6O95503 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX6O95503 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX6O95503 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX6O95503 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX6O95503 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX6O95503 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX6O95503 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX6O95503 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX6O95503 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX6O95503 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX6O95503 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX6O95503 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX6O95503 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX6O95503 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX6O95503 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX6O95503 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX6O95503 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX6O95503 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX6O95503 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX6O95503 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX6O95503 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms