Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCNDBP1O95273 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCNDBP1O95273 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCNDBP1O95273 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCNDBP1O95273 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCNDBP1O95273 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCNDBP1O95273 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCNDBP1O95273 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCNDBP1O95273 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCNDBP1O95273 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCNDBP1O95273 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCNDBP1O95273 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCNDBP1O95273 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCNDBP1O95273 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCNDBP1O95273 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCNDBP1O95273 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCNDBP1O95273 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNDBP1O95273 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms