Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX4O95219 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX4O95219 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX4O95219 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX4O95219 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX4O95219 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX4O95219 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX4O95219 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX4O95219 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX4O95219 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX4O95219 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX4O95219 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX4O95219 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX4O95219 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX4O95219 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX4O95219 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX4O95219 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX4O95219 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX4O95219 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX4O95219 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX4O95219 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX4O95219 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX4O95219 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX4O95219 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX4O95219 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX4O95219 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX4O95219 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX4O95219 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX4O95219 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX4O95219 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX4O95219 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX4O95219 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX4O95219 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX4O95219 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX4O95219 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX4O95219 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX4O95219 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX4O95219 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX4O95219 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX4O95219 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX4O95219 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX4O95219 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX4O95219 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX4O95219 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX4O95219 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX4O95219 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX4O95219 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX4O95219 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX4O95219 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX4O95219 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX4O95219 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX4O95219 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX4O95219 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX4O95219 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX4O95219 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX4O95219 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX4O95219 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX4O95219 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX4O95219 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX4O95219 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNX4O95219 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNX4O95219 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX4O95219 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX4O95219 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX4O95219 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX4O95219 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX4O95219 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX4O95219 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX4O95219 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX4O95219 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX4O95219 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX4O95219 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX4O95219 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX4O95219 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX4O95219 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX4O95219 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX4O95219 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX4O95219 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX4O95219 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX4O95219 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX4O95219 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX4O95219 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX4O95219 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX4O95219 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX4O95219 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX4O95219 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX4O95219 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX4O95219 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX4O95219 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX4O95219 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX4O95219 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX4O95219 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX4O95219 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX4O95219 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX4O95219 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX4O95219 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX4O95219 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX4O95219 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX4O95219 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX4O95219 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms