Protein–RNA interactions for Protein: O95171

SCEL, Sciellin, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCELO95171 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCELO95171 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCELO95171 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCELO95171 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCELO95171 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCELO95171 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCELO95171 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCELO95171 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCELO95171 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCELO95171 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCELO95171 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCELO95171 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCELO95171 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCELO95171 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCELO95171 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCELO95171 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCELO95171 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCELO95171 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCELO95171 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCELO95171 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCELO95171 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCELO95171 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCELO95171 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCELO95171 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCELO95171 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCELO95171 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCELO95171 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCELO95171 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCELO95171 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCELO95171 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCELO95171 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCELO95171 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCELO95171 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCELO95171 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCELO95171 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCELO95171 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCELO95171 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCELO95171 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCELO95171 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCELO95171 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCELO95171 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCELO95171 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCELO95171 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCELO95171 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCELO95171 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCELO95171 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCELO95171 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCELO95171 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCELO95171 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCELO95171 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCELO95171 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCELO95171 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCELO95171 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCELO95171 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCELO95171 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCELO95171 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCELO95171 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCELO95171 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCELO95171 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCELO95171 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCELO95171 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCELO95171 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCELO95171 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCELO95171 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCELO95171 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCELO95171 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCELO95171 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCELO95171 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCELO95171 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCELO95171 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCELO95171 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCELO95171 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCELO95171 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCELO95171 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCELO95171 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCELO95171 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCELO95171 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCELO95171 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCELO95171 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCELO95171 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCELO95171 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCELO95171 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCELO95171 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCELO95171 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCELO95171 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCELO95171 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCELO95171 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCELO95171 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCELO95171 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCELO95171 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCELO95171 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCELO95171 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCELO95171 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCELO95171 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCELO95171 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCELO95171 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCELO95171 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCELO95171 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCELO95171 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCELO95171 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms