Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN15O75808 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CAPN15O75808 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN15O75808 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN15O75808 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN15O75808 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN15O75808 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN15O75808 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN15O75808 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN15O75808 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN15O75808 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN15O75808 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN15O75808 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPN15O75808 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN15O75808 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN15O75808 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN15O75808 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN15O75808 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN15O75808 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN15O75808 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN15O75808 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPN15O75808 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN15O75808 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN15O75808 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN15O75808 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN15O75808 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN15O75808 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN15O75808 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN15O75808 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN15O75808 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPN15O75808 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPN15O75808 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms