Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB3O75712 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB3O75712 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB3O75712 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB3O75712 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB3O75712 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB3O75712 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB3O75712 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB3O75712 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB3O75712 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB3O75712 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB3O75712 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB3O75712 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB3O75712 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB3O75712 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB3O75712 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB3O75712 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB3O75712 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB3O75712 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB3O75712 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB3O75712 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB3O75712 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB3O75712 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB3O75712 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB3O75712 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB3O75712 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB3O75712 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB3O75712 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB3O75712 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB3O75712 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB3O75712 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB3O75712 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB3O75712 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB3O75712 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB3O75712 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB3O75712 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB3O75712 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB3O75712 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB3O75712 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB3O75712 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB3O75712 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB3O75712 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB3O75712 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB3O75712 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB3O75712 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB3O75712 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB3O75712 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB3O75712 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB3O75712 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB3O75712 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB3O75712 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB3O75712 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB3O75712 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB3O75712 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB3O75712 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB3O75712 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJB3O75712 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB3O75712 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB3O75712 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB3O75712 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB3O75712 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB3O75712 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB3O75712 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB3O75712 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB3O75712 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB3O75712 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB3O75712 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJB3O75712 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB3O75712 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB3O75712 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB3O75712 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB3O75712 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB3O75712 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB3O75712 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB3O75712 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB3O75712 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB3O75712 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB3O75712 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB3O75712 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB3O75712 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB3O75712 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB3O75712 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB3O75712 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB3O75712 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB3O75712 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB3O75712 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB3O75712 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB3O75712 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB3O75712 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB3O75712 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB3O75712 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB3O75712 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB3O75712 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB3O75712 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB3O75712 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB3O75712 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB3O75712 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB3O75712 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB3O75712 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB3O75712 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms