Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SURF6O75683 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SURF6O75683 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SURF6O75683 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SURF6O75683 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SURF6O75683 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SURF6O75683 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SURF6O75683 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SURF6O75683 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SURF6O75683 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SURF6O75683 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SURF6O75683 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SURF6O75683 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SURF6O75683 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SURF6O75683 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SURF6O75683 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SURF6O75683 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SURF6O75683 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SURF6O75683 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SURF6O75683 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SURF6O75683 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SURF6O75683 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SURF6O75683 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SURF6O75683 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SURF6O75683 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SURF6O75683 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SURF6O75683 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SURF6O75683 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SURF6O75683 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SURF6O75683 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SURF6O75683 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SURF6O75683 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SURF6O75683 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SURF6O75683 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SURF6O75683 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SURF6O75683 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SURF6O75683 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SURF6O75683 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SURF6O75683 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SURF6O75683 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SURF6O75683 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SURF6O75683 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SURF6O75683 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SURF6O75683 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
SURF6O75683 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SURF6O75683 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SURF6O75683 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SURF6O75683 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SURF6O75683 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SURF6O75683 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SURF6O75683 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SURF6O75683 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SURF6O75683 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SURF6O75683 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SURF6O75683 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SURF6O75683 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SURF6O75683 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SURF6O75683 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SURF6O75683 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SURF6O75683 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SURF6O75683 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SURF6O75683 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SURF6O75683 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SURF6O75683 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SURF6O75683 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SURF6O75683 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SURF6O75683 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SURF6O75683 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SURF6O75683 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SURF6O75683 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SURF6O75683 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SURF6O75683 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SURF6O75683 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SURF6O75683 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SURF6O75683 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SURF6O75683 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SURF6O75683 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SURF6O75683 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SURF6O75683 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SURF6O75683 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SURF6O75683 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SURF6O75683 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SURF6O75683 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SURF6O75683 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SURF6O75683 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SURF6O75683 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SURF6O75683 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SURF6O75683 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SURF6O75683 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SURF6O75683 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SURF6O75683 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SURF6O75683 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SURF6O75683 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SURF6O75683 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SURF6O75683 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SURF6O75683 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SURF6O75683 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SURF6O75683 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SURF6O75683 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SURF6O75683 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms