Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PMPCBO75439 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PMPCBO75439 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PMPCBO75439 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMPCBO75439 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMPCBO75439 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMPCBO75439 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMPCBO75439 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMPCBO75439 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMPCBO75439 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMPCBO75439 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMPCBO75439 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMPCBO75439 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMPCBO75439 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMPCBO75439 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMPCBO75439 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMPCBO75439 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMPCBO75439 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMPCBO75439 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMPCBO75439 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMPCBO75439 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMPCBO75439 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMPCBO75439 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMPCBO75439 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMPCBO75439 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMPCBO75439 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMPCBO75439 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMPCBO75439 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMPCBO75439 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMPCBO75439 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMPCBO75439 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMPCBO75439 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMPCBO75439 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMPCBO75439 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMPCBO75439 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms