Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRCH4O75427 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRCH4O75427 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRCH4O75427 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRCH4O75427 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRCH4O75427 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRCH4O75427 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRCH4O75427 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRCH4O75427 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRCH4O75427 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRCH4O75427 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRCH4O75427 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRCH4O75427 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRCH4O75427 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRCH4O75427 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRCH4O75427 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LRCH4O75427 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRCH4O75427 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRCH4O75427 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRCH4O75427 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRCH4O75427 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRCH4O75427 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRCH4O75427 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRCH4O75427 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LRCH4O75427 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRCH4O75427 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms