Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA2O75334 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms