Protein–RNA interactions for Protein: O75264

SMIM24, Small integral membrane protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM24O75264 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM24O75264 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM24O75264 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM24O75264 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM24O75264 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMIM24O75264 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM24O75264 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM24O75264 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM24O75264 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM24O75264 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM24O75264 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM24O75264 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM24O75264 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM24O75264 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM24O75264 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM24O75264 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM24O75264 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM24O75264 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM24O75264 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM24O75264 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM24O75264 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM24O75264 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM24O75264 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM24O75264 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM24O75264 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM24O75264 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM24O75264 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM24O75264 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM24O75264 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms