Protein–RNA interactions for Protein: O75175

CNOT3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT3O75175 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNOT3O75175 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT3O75175 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms