Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF40O75150 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF40O75150 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF40O75150 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF40O75150 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF40O75150 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF40O75150 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF40O75150 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF40O75150 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF40O75150 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF40O75150 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF40O75150 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF40O75150 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF40O75150 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF40O75150 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF40O75150 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF40O75150 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF40O75150 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF40O75150 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF40O75150 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF40O75150 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF40O75150 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF40O75150 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF40O75150 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF40O75150 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF40O75150 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF40O75150 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF40O75150 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF40O75150 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF40O75150 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF40O75150 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF40O75150 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF40O75150 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF40O75150 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF40O75150 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF40O75150 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF40O75150 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF40O75150 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF40O75150 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF40O75150 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF40O75150 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF40O75150 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF40O75150 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF40O75150 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF40O75150 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF40O75150 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF40O75150 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF40O75150 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF40O75150 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF40O75150 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF40O75150 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF40O75150 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF40O75150 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF40O75150 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF40O75150 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF40O75150 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF40O75150 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF40O75150 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF40O75150 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF40O75150 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF40O75150 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF40O75150 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF40O75150 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF40O75150 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF40O75150 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF40O75150 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF40O75150 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF40O75150 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF40O75150 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF40O75150 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF40O75150 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF40O75150 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF40O75150 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF40O75150 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF40O75150 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF40O75150 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF40O75150 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF40O75150 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF40O75150 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF40O75150 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF40O75150 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF40O75150 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RNF40O75150 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF40O75150 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF40O75150 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF40O75150 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF40O75150 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF40O75150 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF40O75150 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF40O75150 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF40O75150 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF40O75150 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF40O75150 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF40O75150 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF40O75150 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF40O75150 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF40O75150 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF40O75150 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF40O75150 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF40O75150 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms