Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG13O75143 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG13O75143 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG13O75143 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG13O75143 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG13O75143 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG13O75143 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG13O75143 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG13O75143 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG13O75143 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG13O75143 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG13O75143 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG13O75143 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG13O75143 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG13O75143 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG13O75143 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG13O75143 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG13O75143 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG13O75143 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG13O75143 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG13O75143 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG13O75143 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG13O75143 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG13O75143 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG13O75143 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG13O75143 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG13O75143 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG13O75143 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG13O75143 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG13O75143 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG13O75143 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG13O75143 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG13O75143 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG13O75143 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG13O75143 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG13O75143 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG13O75143 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG13O75143 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG13O75143 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG13O75143 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG13O75143 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG13O75143 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG13O75143 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG13O75143 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG13O75143 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG13O75143 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG13O75143 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG13O75143 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG13O75143 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG13O75143 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG13O75143 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG13O75143 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG13O75143 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG13O75143 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG13O75143 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG13O75143 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG13O75143 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG13O75143 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG13O75143 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG13O75143 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG13O75143 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG13O75143 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG13O75143 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG13O75143 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG13O75143 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG13O75143 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG13O75143 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG13O75143 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG13O75143 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG13O75143 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG13O75143 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG13O75143 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG13O75143 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG13O75143 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG13O75143 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG13O75143 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG13O75143 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG13O75143 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG13O75143 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG13O75143 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG13O75143 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG13O75143 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG13O75143 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG13O75143 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG13O75143 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG13O75143 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG13O75143 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG13O75143 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG13O75143 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG13O75143 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG13O75143 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG13O75143 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG13O75143 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG13O75143 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG13O75143 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG13O75143 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG13O75143 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG13O75143 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG13O75143 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG13O75143 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms