Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC22O60826 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC22O60826 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms