Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRP9O43818 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRP9O43818 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRP9O43818 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRP9O43818 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRP9O43818 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRP9O43818 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRP9O43818 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRP9O43818 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRP9O43818 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRP9O43818 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRP9O43818 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRP9O43818 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRP9O43818 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRP9O43818 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RRP9O43818 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRP9O43818 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRP9O43818 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRP9O43818 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRP9O43818 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRP9O43818 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRP9O43818 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRP9O43818 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRP9O43818 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRP9O43818 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RRP9O43818 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRP9O43818 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRP9O43818 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRP9O43818 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRP9O43818 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRP9O43818 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRP9O43818 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRP9O43818 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRP9O43818 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRP9O43818 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRP9O43818 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRP9O43818 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRP9O43818 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RRP9O43818 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRP9O43818 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRP9O43818 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRP9O43818 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRP9O43818 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRP9O43818 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRP9O43818 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRP9O43818 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRP9O43818 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRP9O43818 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRP9O43818 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRP9O43818 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRP9O43818 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RRP9O43818 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRP9O43818 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRP9O43818 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRP9O43818 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RRP9O43818 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RRP9O43818 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRP9O43818 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRP9O43818 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRP9O43818 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRP9O43818 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRP9O43818 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRP9O43818 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRP9O43818 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRP9O43818 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RRP9O43818 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRP9O43818 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRP9O43818 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRP9O43818 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RRP9O43818 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRP9O43818 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRP9O43818 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRP9O43818 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRP9O43818 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRP9O43818 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRP9O43818 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRP9O43818 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRP9O43818 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RRP9O43818 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRP9O43818 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRP9O43818 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRP9O43818 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RRP9O43818 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRP9O43818 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRP9O43818 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRP9O43818 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRP9O43818 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRP9O43818 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRP9O43818 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRP9O43818 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRP9O43818 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRP9O43818 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRP9O43818 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRP9O43818 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRP9O43818 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRP9O43818 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRP9O43818 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRP9O43818 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRP9O43818 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRP9O43818 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms