Protein–RNA interactions for Protein: O43791

SPOP, Speckle-type POZ protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOPO43791 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPOPO43791 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPOPO43791 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPOPO43791 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPOPO43791 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPOPO43791 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPOPO43791 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPOPO43791 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPOPO43791 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPOPO43791 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPOPO43791 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPOPO43791 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPOPO43791 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPOPO43791 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPOPO43791 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPOPO43791 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPOPO43791 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPOPO43791 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPOPO43791 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPOPO43791 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPOPO43791 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPOPO43791 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPOPO43791 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPOPO43791 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPOPO43791 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPOPO43791 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPOPO43791 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPOPO43791 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPOPO43791 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPOPO43791 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPOPO43791 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPOPO43791 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPOPO43791 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPOPO43791 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPOPO43791 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPOPO43791 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPOPO43791 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPOPO43791 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPOPO43791 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPOPO43791 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPOPO43791 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPOPO43791 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPOPO43791 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPOPO43791 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPOPO43791 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPOPO43791 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPOPO43791 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPOPO43791 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPOPO43791 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPOPO43791 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPOPO43791 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPOPO43791 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPOPO43791 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPOPO43791 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPOPO43791 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPOPO43791 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPOPO43791 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPOPO43791 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPOPO43791 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPOPO43791 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPOPO43791 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPOPO43791 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPOPO43791 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPOPO43791 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPOPO43791 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPOPO43791 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPOPO43791 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SPOPO43791 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOPO43791 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOPO43791 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOPO43791 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOPO43791 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOPO43791 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOPO43791 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOPO43791 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOPO43791 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOPO43791 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOPO43791 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOPO43791 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOPO43791 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOPO43791 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOPO43791 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOPO43791 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOPO43791 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOPO43791 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOPO43791 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOPO43791 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOPO43791 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOPO43791 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOPO43791 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPOPO43791 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPOPO43791 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPOPO43791 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPOPO43791 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPOPO43791 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPOPO43791 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPOPO43791 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SPOPO43791 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPOPO43791 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPOPO43791 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms