Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDELR3O43731 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms