Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COCHO43405 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COCHO43405 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COCHO43405 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COCHO43405 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COCHO43405 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COCHO43405 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COCHO43405 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COCHO43405 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COCHO43405 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COCHO43405 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COCHO43405 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COCHO43405 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COCHO43405 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COCHO43405 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COCHO43405 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COCHO43405 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COCHO43405 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COCHO43405 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COCHO43405 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COCHO43405 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COCHO43405 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COCHO43405 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COCHO43405 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COCHO43405 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COCHO43405 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
COCHO43405 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COCHO43405 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COCHO43405 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COCHO43405 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COCHO43405 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COCHO43405 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COCHO43405 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COCHO43405 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
COCHO43405 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COCHO43405 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COCHO43405 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COCHO43405 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COCHO43405 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COCHO43405 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COCHO43405 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
COCHO43405 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COCHO43405 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COCHO43405 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COCHO43405 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COCHO43405 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COCHO43405 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COCHO43405 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COCHO43405 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COCHO43405 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COCHO43405 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COCHO43405 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COCHO43405 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COCHO43405 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COCHO43405 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COCHO43405 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COCHO43405 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
COCHO43405 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COCHO43405 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COCHO43405 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COCHO43405 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COCHO43405 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COCHO43405 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COCHO43405 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COCHO43405 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COCHO43405 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COCHO43405 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
COCHO43405 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COCHO43405 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COCHO43405 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COCHO43405 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COCHO43405 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COCHO43405 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COCHO43405 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COCHO43405 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COCHO43405 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
COCHO43405 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COCHO43405 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COCHO43405 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COCHO43405 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COCHO43405 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COCHO43405 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COCHO43405 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COCHO43405 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COCHO43405 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COCHO43405 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
COCHO43405 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COCHO43405 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COCHO43405 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COCHO43405 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COCHO43405 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COCHO43405 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COCHO43405 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COCHO43405 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COCHO43405 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COCHO43405 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COCHO43405 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COCHO43405 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COCHO43405 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COCHO43405 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms