Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGSM2O43147 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGSM2O43147 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms