Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN2DO15399 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN2DO15399 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN2DO15399 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN2DO15399 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN2DO15399 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN2DO15399 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN2DO15399 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN2DO15399 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN2DO15399 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN2DO15399 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN2DO15399 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2DO15399 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2DO15399 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2DO15399 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2DO15399 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2DO15399 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2DO15399 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2DO15399 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2DO15399 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2DO15399 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2DO15399 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2DO15399 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2DO15399 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2DO15399 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2DO15399 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2DO15399 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN2DO15399 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN2DO15399 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN2DO15399 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN2DO15399 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN2DO15399 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN2DO15399 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN2DO15399 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN2DO15399 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms