Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEMA3EO15041 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEMA3EO15041 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA3EO15041 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms