Protein–RNA interactions for Protein: O00562

PITPNM1, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM1O00562 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PITPNM1O00562 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PITPNM1O00562 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms