Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NFKBIEO00221 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFKBIEO00221 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms