Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QR89 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QR89 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QR89 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QR89 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QR89 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QR89 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QR89 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QR89 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QR89 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QR89 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QR89 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QR89 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QR89 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QR89 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QR89 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QR89 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QR89 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QR89 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QR89 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3QR89 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3QR89 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3QR89 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3QR89 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3QR89 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3QR89 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3QR89 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3QR89 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3QR89 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3QR89 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3QR89 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3QR89 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3QR89 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3QR89 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
J3QR89 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QR89 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QR89 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QR89 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QR89 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QR89 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QR89 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QR89 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QR89 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QR89 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QR89 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QR89 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QR89 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QR89 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QR89 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QR89 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QR89 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QR89 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QR89 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QR89 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
J3QR89 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3QR89 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3QR89 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3QR89 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3QR89 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
J3QR89 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
J3QR89 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
J3QR89 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
J3QR89 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
J3QR89 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
J3QR89 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
J3QR89 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
J3QR89 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
J3QR89 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
J3QR89 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
J3QR89 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QR89 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QR89 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QR89 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QR89 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QR89 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QR89 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QR89 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QR89 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QR89 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QR89 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QR89 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QR89 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QR89 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QR89 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QR89 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QR89 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
J3QR89 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QR89 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QR89 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QR89 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QR89 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QR89 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QR89 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QR89 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QR89 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QR89 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QR89 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QR89 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QR89 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QR89 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms