Protein–RNA interactions for Protein: H3BNL8

C6orf229, Uncharacterized protein C6orf229, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf229H3BNL8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
C6orf229H3BNL8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C6orf229H3BNL8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms