Protein–RNA interactions for Protein: F8VP50

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VP50 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
F8VP50 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
F8VP50 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
F8VP50 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
F8VP50 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
F8VP50 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
F8VP50 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
F8VP50 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
F8VP50 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
F8VP50 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
F8VP50 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
F8VP50 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
F8VP50 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
F8VP50 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
F8VP50 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
F8VP50 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
F8VP50 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
F8VP50 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
F8VP50 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
F8VP50 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
F8VP50 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
F8VP50 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
F8VP50 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
F8VP50 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
F8VP50 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
F8VP50 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
F8VP50 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
F8VP50 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
F8VP50 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
F8VP50 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
F8VP50 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
F8VP50 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
F8VP50 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
F8VP50 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
F8VP50 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
F8VP50 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
F8VP50 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
F8VP50 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
F8VP50 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
F8VP50 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
F8VP50 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
F8VP50 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
F8VP50 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
F8VP50 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
F8VP50 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
F8VP50 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
F8VP50 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
F8VP50 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
F8VP50 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
F8VP50 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
F8VP50 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
F8VP50 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
F8VP50 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
F8VP50 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
F8VP50 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
F8VP50 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
F8VP50 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
F8VP50 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
F8VP50 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
F8VP50 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
F8VP50 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
F8VP50 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
F8VP50 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
F8VP50 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
F8VP50 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
F8VP50 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
F8VP50 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
F8VP50 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
F8VP50 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
F8VP50 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
F8VP50 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
F8VP50 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
F8VP50 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
F8VP50 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
F8VP50 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
F8VP50 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
F8VP50 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
F8VP50 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
F8VP50 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
F8VP50 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
F8VP50 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
F8VP50 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
F8VP50 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
F8VP50 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
F8VP50 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
F8VP50 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
F8VP50 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
F8VP50 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
F8VP50 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
F8VP50 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
F8VP50 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
F8VP50 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
F8VP50 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
F8VP50 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
F8VP50 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
F8VP50 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
F8VP50 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
F8VP50 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
F8VP50 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
F8VP50 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms