Protein–RNA interactions for Protein: C9JI98

TMEM238, Transmembrane protein 238, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM238C9JI98 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM238C9JI98 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM238C9JI98 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms