Protein–RNA interactions for Protein: C9IYK1

Gap junction protein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9IYK1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9IYK1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C9IYK1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
C9IYK1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
C9IYK1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C9IYK1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C9IYK1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C9IYK1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C9IYK1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C9IYK1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C9IYK1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C9IYK1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C9IYK1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C9IYK1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C9IYK1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C9IYK1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C9IYK1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C9IYK1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C9IYK1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C9IYK1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C9IYK1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C9IYK1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C9IYK1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C9IYK1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C9IYK1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C9IYK1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C9IYK1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9IYK1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9IYK1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9IYK1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9IYK1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9IYK1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9IYK1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C9IYK1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9IYK1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9IYK1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9IYK1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9IYK1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C9IYK1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9IYK1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9IYK1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C9IYK1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C9IYK1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9IYK1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C9IYK1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C9IYK1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C9IYK1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C9IYK1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C9IYK1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C9IYK1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9IYK1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9IYK1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9IYK1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9IYK1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9IYK1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9IYK1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9IYK1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9IYK1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9IYK1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9IYK1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C9IYK1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9IYK1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9IYK1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9IYK1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9IYK1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9IYK1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9IYK1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9IYK1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9IYK1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9IYK1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9IYK1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C9IYK1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9IYK1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9IYK1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9IYK1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9IYK1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9IYK1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C9IYK1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9IYK1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C9IYK1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9IYK1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9IYK1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9IYK1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C9IYK1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C9IYK1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C9IYK1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C9IYK1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C9IYK1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C9IYK1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C9IYK1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C9IYK1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C9IYK1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C9IYK1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9IYK1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9IYK1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9IYK1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9IYK1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9IYK1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9IYK1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9IYK1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms