Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DEV8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DEV8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DEV8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DEV8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
B4DEV8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DEV8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DEV8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DEV8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DEV8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DEV8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DEV8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DEV8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DEV8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DEV8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DEV8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DEV8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DEV8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DEV8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DEV8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DEV8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DEV8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DEV8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DEV8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
B4DEV8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
B4DEV8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
B4DEV8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
B4DEV8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
B4DEV8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
B4DEV8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
B4DEV8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
B4DEV8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
B4DEV8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
B4DEV8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
B4DEV8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
B4DEV8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
B4DEV8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
B4DEV8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
B4DEV8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
B4DEV8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
B4DEV8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
B4DEV8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
B4DEV8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
B4DEV8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
B4DEV8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
B4DEV8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4DEV8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4DEV8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4DEV8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4DEV8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4DEV8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4DEV8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4DEV8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4DEV8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4DEV8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4DEV8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4DEV8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4DEV8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4DEV8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4DEV8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4DEV8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4DEV8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DEV8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DEV8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DEV8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DEV8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DEV8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DEV8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DEV8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DEV8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DEV8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DEV8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DEV8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DEV8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DEV8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DEV8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DEV8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DEV8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DEV8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DEV8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DEV8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DEV8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DEV8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DEV8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DEV8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DEV8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DEV8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DEV8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DEV8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DEV8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DEV8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DEV8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DEV8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DEV8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DEV8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DEV8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DEV8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DEV8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DEV8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DEV8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms