Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PP2D1A8MPX8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PP2D1A8MPX8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms