Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms