Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C4orf47A7E2U8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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C4orf47A7E2U8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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C4orf47A7E2U8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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C4orf47A7E2U8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C4orf47A7E2U8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
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