Protein–RNA interactions for Protein: A6NLE4

SMIM23, Small integral membrane protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM23A6NLE4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM23A6NLE4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms