Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA6L4A6NEF3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA6L4A6NEF3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms