Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L4A6NCW7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L4A6NCW7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
USP17L4A6NCW7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L4A6NCW7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L4A6NCW7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms