Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC162PA2VCL2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC162PA2VCL2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms