Protein–RNA interactions for Protein: A0A539

TCRBV7S3A2, T-cell receptor beta variable 4-2 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV7S3A2A0A539 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCRBV7S3A2A0A539 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
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TCRBV7S3A2A0A539 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TCRBV7S3A2A0A539 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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