Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWV2

TRBV4-1, T-cell receptor beta variable 4-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRBV4-1A0A0J9YWV2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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