Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP35Q9P2H5 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
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