Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 TACC1-201ENST00000276520 6513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC005696.4-201ENST00000614400 3147 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PSMD5-201ENST00000210313 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AOC2-202ENST00000452774 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 MIGA2-201ENST00000358369 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 OR1I1-202ENST00000641398 5984 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ATP2A3-203ENST00000359983 3290 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PNPLA6-220ENST00000600737 4195 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 NPC1L1-204ENST00000546276 4826 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 BTG1-201ENST00000256015 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 WBP1L-202ENST00000448841 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 USP5-201ENST00000229268 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 POFUT2-203ENST00000349485 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 FLJ30679-201ENST00000624773 1980 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 DBF4B-202ENST00000393547 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 F2R-201ENST00000319211 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ZBTB26-201ENST00000373654 2047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PYGO2-202ENST00000368457 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PLK4-209ENST00000513090 3123 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 POFUT2-213ENST00000612472 2959 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PDE1B-203ENST00000538346 1711 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SYNPO-202ENST00000394243 7063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ACSF3-218ENST00000614302 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ABL2-204ENST00000502732 12144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SLC26A4-201ENST00000265715 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 NPR3-201ENST00000265074 7344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 TJP2-209ENST00000539225 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 GAB2-201ENST00000340149 6052 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AIF1L-201ENST00000247291 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 RNF219-AS1-209ENST00000606429 2418 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 HERC2P9-206ENST00000529624 5187 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 C2orf69-201ENST00000319974 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 OTUD6B-201ENST00000285420 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PLA2G4E-AS1-201ENST00000499478 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 HNF1A-208ENST00000541395 3332 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 TMCC2-208ENST00000545499 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 P2RX1-201ENST00000225538 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 INAVA-201ENST00000367342 4298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PCDHGA9-201ENST00000573521 4605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PCDHB15-201ENST00000231173 4017 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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