Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ACVR2B-201ENST00000352511 11821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 TMX1-201ENST00000457354 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 LVRN-202ENST00000395528 4544 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 SVIL-201ENST00000355867 7586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 TMEM33-203ENST00000504986 7482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 COL5A2-203ENST00000618828 6399 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 KANSL1-208ENST00000574590 5147 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 BARD1-212ENST00000617164 5449 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 GPR107-202ENST00000372406 7353 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 STAT1-201ENST00000361099 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 B3GAT2-202ENST00000615536 5206 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 SLIT2-212ENST00000622093 6380 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
RETNLBQ9BQ08 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms